Happinet 公布了《圣剑联盟：深渊》发售后更新补丁的发布计划，公告除了日文版，也通过本作的 Steam 页面发布了英文版。

首个更新补丁今天已经上线，带来这些调整：剧情模式开局显示通关条件；调整十字键输入；半人马与奇隆在森林地形上不再降低移动力；入侵阶段 CPU 攻击玩家基地后，下一季度不会再次攻击同一基地；此外还有多项修复。

Happinet 与 NIS America 还在 Steam 页面另发了一篇公告，详细说明未来几个月内上线的 3 个更新补丁。其中明年 4 月的第 4 弹更新被特别标注为大型补丁，团队会为单位配置和难度设定加入更多自定义功能。

更新 2 计划于 2026 年 12 月发布：装备界面追加排序功能；美人鱼、约格索斯等水生怪物在水地形上不再降低闪避；追加调整 HP 槽大小的选项；追加小地图开关选项；扩大战场地图上树木显示缩小的范围；调整各阵营配乐；以及多项修复。

更新 3 计划于 2027 年 2 月发布，追加排序功能等（原文此处截断）。