《耀西与神秘书》讲述了一本会说话的书Mr. E从天而降，落在了耀西和他的朋友们居住的岛上的故事。当他们相遇后，耀西得知Mr. E的困境：他的书页上住着各种奇特的生物，但这本健谈的书却记不起它们中的任何一个！玩家将扮演耀西，帮助Mr. E回忆起他的内容，探索多彩的栖息地，在每一页上都有新的惊喜。

在接受Famitsu采访时，《耀西与神秘书》的导演山本雅弘和制作人野上久志详细讨论了游戏的开发过程。他们透露，团队至少花费一个月的时间开发游戏中的每一个生物，但与第六章节的开发时间相比，这显得微不足道。第六章节向玩家介绍了Bewilder Bird，令人难以置信的是，团队花费了3年时间来完善那个特定的生物及其栖息地。

山本雅弘表示："我认为Bewilder Bird的制作可能单独就花了大约三年时间。"

野上久志补充道："我一点一点地添加内容，并继续在其他项目的同时进行这项工作。"

山本雅弘坦言："我觉得游戏开发得不够完善，需要更多的添加。随着生物数量的增加，所需的工作量也随之增加，所以我一直在继续工作。"