在《我的世界：故事模式》中，玩家将操控主角Jesse与朋友们踏上一段寻找“岩石之令”以拯救世界的冒险之旅。在故事中玩家将领略到《我的世界》中的下界，边境之地，末地以及更多神秘的区域。游戏吸取了来自《我的世界》社区的大量反馈，并分为章节独立推出。

章节一：岩石之令

“我的世界”中的小人儿Jesse和他的朋友们为主角，他们一直以来坚定地信奉着传奇般存在的岩石之令，这个法则规定了他们应该做什么——勇士、红石工程师、滋事者与建筑师。然而有一天4名冒险者屠杀了一只末影龙，释放出某个恐怖的东西，杰西和他的朋友们将就此踏上一场寻找的征程，并拯救这个濒临灭亡的世界。

章节二：集结号令

10月28日我的世界故事模式第二章正式公布，名字叫做集结号令。在游戏的第二章节中，对于我们无畏的英雄来说时间已然不够。凋零风暴即将逼近，将吞噬一切活物。这时候Jesse和朋友将做出抉择，选择究竟是探索混沌王国还是壮观的红石奇迹来找寻侠盗Magnus或是工程师Ellegaard，这些传奇角色能帮助英雄们结束迫近的威胁吗?剧情：第一章的剧情中其实杰西等人面对的威胁和困难还并不是很多，遇到的怪物也不是那么强大，都是大家在原版的MC中常见的。从第一张的剧情上来看，一开始通过引出传说中的队伍传奇故事，引射到玩家操作的杰西队伍身上，通过末影嘉年华事件导出更多的后续故事和玩家选择。但是第二章来了，剧情的战斗场面是比较多的，所以剧情的激烈性比较强。