《孤岛先锋》中除了各具特色的英雄角色，玩家还能通过游戏中的秘宝系统进一步打造个性化的角色。游戏开局时，玩家可以从系统随机给出的三个秘宝中选择一个带入战场，战斗中也可以通过开启宝箱或击败对手获取更多秘宝。秘宝能够通过增强角色属性，改写游戏机制，强化攻防手段等方式影响游戏走势，多达二十余种秘宝可以产生海量的组合，进而催生与众不同的英雄。